Le syndrome de fatigue chronique (SFC) demeure difficile à diagnostiquer car il faut, dans un premier temps, procéder par élimination, en recherchant d'autres maladies aux symptômes apparentés (notamment la maladie de Crohn, l'hépatite C, le sida, la mononucléose grave ou la dépression). Si on a de bonnes raisons de se croire victime du SFC, le médecin consulté, référera la personne à un spécialiste en microbiologie, qui éliminera de son diagnostic toute maladie infectieuse grave. De manière générale, le SFC commence par une vilaine grippe ou toute infection virale accompagnée de fièvre, de fatigue intense, de douleurs musculaires et de maux de tête. Un diagnostic de SFC nécessite la présence de tous les symptômes suivants :

• fatigue intense et prolongée qui empêche de reprendre ses activités ;
• douleurs articulaires et musculaires qui durent après la grippe ;
• difficultés de concentration ;
• vertige ;
• apparition récurrente de ganglions au cou et aux aisselles.